《古事记》中记载了这样一个故事，三贵子之一的素盏鸣尊（须佐之男命）杀死了代表食物与繁荣的地母神，于是地母神的尸体上就长出了无限食物的谷物种子以及象征财富的牛马。
绳纹时代曾经流行着这样一个巫术，当杀死象征繁荣与丰饶的地母神，打碎其人偶，土地上的作物就可以获得丰受。
传说中被素盏鸣尊杀死的地母神就是古老的稻荷神，掌管着无限的食物与财富。
现在的稻荷神宇迦之御魂大神是素盏鸣尊的女儿，因为素盏鸣尊杀死了古老的稻荷神，所以从古老的稻荷神尸体上诞生的稻米精灵，则成为了新的稻荷神。
稻荷神一直以素盏鸣尊的女儿，未婚的女神形象出现，似乎与母性隔绝，然而在古老的传说中曾经的稻荷神是一位母亲。
大地是女神的子宫，当地球被创造出来，无数的生命在女神的子宫里孕育。
然而女神的孩子，一名已经被历史忘记，失去了名字的邪神，稻荷神之子不仅想要女神所有的食物和财富，甚至想要女神丰饶的力量来源，女神的子宫。
女神很爱自己的孩子，可是女神的子宫孕育着的不止他一个儿子，食物和财富，即便是女神之子也不能独享。
因此稻荷神之子心中有了阴谋，他在诸神的宴会中欺骗素盏鸣尊，让他以为女神从自己子宫里取出食物是对他的不敬。
古老的稻荷神被素盏鸣尊所杀，死于自己孩子的阴谋。
女神死后，大地荒芜，丰饶不再，诸神这才意识到上了当，于是杀死了夺走女神子宫的邪神。
继承了古老稻荷神神力的新生稻荷神也继承了女神的执念，她原谅了邪神，请求众神不要彻底消灭他。
因此邪神没有完全死去，却也没有复活，只能永远被封印在人间。
只是没想到的是邪神依然引诱着人类，通过献祭自己的父母来获得力量。
……
从绳文时代开始，人类就已经利用巫术的力量获得丰收，巫师们更是发现了稻荷神之子的秘密，因此昔日的巫师们，在阴阳道传来，并因此大兴后，转行成阴阳师后暗地里分享稻荷神之子的秘密，并纷纷发誓只传给直系后代。
时间到了江户时代，掌握稻荷神之子秘密的家族纷纷断绝，只剩下黑川家一脉，黑川久望通过和邪神的交易，获得了天下无敌的力量，成为了帝国的贵族，黑川伯爵。
主人公黑川清隆母亲是黑川伯爵的情人，因为生病了，所以被赶出黑川家。母亲临走前请求黑川伯爵赐予自己的儿子黑川的姓氏，得到了允许。
清隆的母亲带着清隆回到了家乡，清隆承担着照顾重病的母亲的职责。因为黑川清隆的天赋和特殊的才能，受到了偶然路过的荒田神官的青睐，荒田神官将其收为弟子，并带回了伊势神宫。
卓越的才华，受到荒田神官儿子荒田信一的忌惮，担忧黑川清隆会威胁他的地位，于是在父亲荒田神官逝世后，开始针对他。
伊势神宫负责内宫祭祀的荒田信一神主与外宫祭祀的度会神主合谋，欺骗自己的妹妹荒田结衣，引诱黑川清隆来到藏有《神道五部书》的地方。
黑川清隆与荒田结衣是青梅竹马，彼此之间也是天作之后，因此清隆没有怀疑，到了之后才发现是一场阴谋，荒田结衣早已经被自己的兄长，也就是黑川清隆的大师兄许配给度会家的少主。
偷看神道五部书在伊势神宫是绝对的禁忌，因此黑川清隆在混乱中带走了荒田结衣，杀死了度会家的少主，因此遭遇到伊势神宫的追杀。
黑川清隆在追杀中受伤，黑川七夜在这个时候中途穿越到黑川清隆身上，因为清隆的意识影响主角，所以在杀死青梅竹马的荒田结衣之后一路直奔东京，在火车上偶遇了天下第一的阴阳师贺茂道世。
军部和伊势神宫互相勾结，因为战局不利，所以知晓主角的身份的军部期望获得邪神的力量，对抗米国。
黑川清隆的生父就是上一代献祭了自己母亲，和邪神交易的人，也是最后一个知晓秘密的人，帝国的黑川久望伯爵。
黑川七夜再度见到了贺茂道世从他的口中知道了关于稻荷神之子的部分秘密，天照大神推动命运，希望黑川七夜杀死邪神，丰受大神（当代稻荷神的分身）则不许这么干。
黑川清隆既是黑川七夜现实世界的祖父，在小说世界，也同样是黑川七夜的祖父。黑川七夜以黑川清隆的身份冲过帝国的封锁来到了黑川家的府邸，见到了父亲黑川久望。
黑川七夜（黑川清隆）烧掉了自己奶奶的尸体，黑川久望出于愧疚的心情，愿意补偿，因此带着他来到封印稻荷神之子的地宫。
清隆父子进入邪神的宫殿，因为并不贪欲邪神的力量和诱惑，因此最终杀死了邪神。
然而稻荷神出现了，因为昔日执念的缘故，稻荷神想要杀掉黑川七夜，可是却因为现在的稻荷神并不是以前的稻荷神，所以愿意给主角一个愿望。
黑川七夜以祖父黑川清隆的名义向稻荷神许下愿望，希望稻荷神能够赐予他一个光辉灿烂，如稻荷神一般完美无瑕的女儿，降临到黑川家。
然而稻荷神找不出一个能够和她同等光辉灿烂的女儿，因此只能自己降临到黑川家，成为黑川家的女儿，而她也就会在将来成为黑川七夜的妈妈。
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